甘丹赤巴是格魯传承最崇高的领袖，法王的地位尊贵如在世宗喀巴大师。这个崇高的地位，可追溯到尊贵的宗喀巴大师。宗喀巴大师于1409年创建甘丹寺。其众多的弟子中，最著名的是贾曹杰(1364-1431)与克珠杰(1385-1438)。

宗喀巴大师圆寂之后，贾曹杰依循大师的教义，成为第一任甘丹赤巴 — 甘丹寺法座及宗喀巴大师在世的代表。继贾曹杰之后，克珠杰成为第二任甘丹赤巴。享有盛誉的甘丹赤巴就这样通过不间断的传承至今日的第101任甘丹赤巴。

地位崇高的甘丹寺法座的持有人须通过严格的甄选过程，这需要多年广泛的培训和在寺院内的最高职位服务，担任主诵师及上密院或下密院住持。

这个制度使得每位僧人皆能凭藉个人的学术素养，对佛法的精进修行还有对寺庙的贡献，使自己有机会晋升至甘丹赤巴的宝座。法座的传承反映了佛教的平等精神：即使是普通的农村男孩也可凭着他的努力，成为格鲁派传承最崇高的喇嘛。

现任甘丹赤巴是第101任甘丹赤巴龙日南杰法王。法王现居于法国巴黎。